Bu tez çalışmasında, Orta Karadeniz’de dağılım gösteren Liocarcinus
navigator, Liocarcinus depurator ve Eriphia verrucosa türlerinin genetik yapısı
belirlenmiş, gen bankasındaki bu familyanın üyeleri arasındaki genet ik ilişkinin
derecesi mtDNA ve rDNA sekans analiz yöntemiyle analiz edilerek soyağacı
çıkartılmıştır. Çalışılan gen bölgeleri PZR yöntem ile çoğaltılarak gen dizilimleri
belirlenmiştir. Örneklemesi yapılan yengeç türleri bölgede ticari olarak kullanılan
farklı av araçları elde edilmiştir.18S rDNA gen bölgesi 718 bç’nden 649 bç’nin
(%90.4) pozisyonunun korunmuş ve 10 bç’nin (%14.5) polimorfik bilgi verici olan 69
bç’nin (%9.6) nükleotid pozisyonunda değişken olduğu belirlenmiştir. Çalışılan türler
için 18S rDNA nükleotit çeşitlilik değeri (Pi) 0.02472 ve haplotip çeşitlilik değeri (Hd)
1 olarak hesaplanmıştır. mtDNA COI gen bölgesi 456 bç’nden 44 bç’nin (%9.6)
pozisyonunun korunmuş ve 312 bç’nin (%75.7) parsominok bilgi verici olan 412
bç’nin (%90.4) nükleotid pozisyonunda değişken olduğu belirlenmiştir. Çalışılan
türler için nükleotid çeşitlilik değeri (Pi) 0.3546 ve haplotip çeşitlilik değeri (Hd) 1
olarak hesaplanmıştır.,
In this thesis, the genetic structure of the Liocarcinus navigator, Liocarcinus
depurator and Eriphia verrucosa species distributed in the Middle Black Sea was
determined, the genetic relationship between the members of this family in the gene
bank was analyzed by mtDNA and rDNA sequence analysis method and the
genealogical tree was extracted. The studied gene regions was determined by PCR
amplification. The sampled crab species were obtained by different commercially
fishing gear used in the region. For the 18S rDNA partial gene region, a total of 718
characters for each of the individuals sequenced were aligned, 649 (90.4%) characters
were constant, 69 (9.6%) characters were variable and 10 (14.5%) variable characters
were parsimony-informative under the MP optimality criterion. For the studied
species, 18S rDNA nucleotide diversity (Pi) and haplotype diversity (Hd) values were
calculated as 0.02472 and 1, respectively. For the mtDNA COI gene region, a total of
456 characters for the individuals sequenced were aligned, 44 (9.6%) characters were
constant, 412 (90.4%) characters were variable and 312 bp (75.7%) variable characters
were parsimony-informative under the MP optimality criterion. Also, mtDNA COI
nucleotide diversity (Pi) and haplotype diversity (Hd) values were calculated as 0.3546
and 1, respectively.
